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图/表 详细信息
磷脂酶A2受体相关膜性肾病中铁死亡的生物信息学分析与实验验证
黄曼霞, 何雨阳, 李仰溥, 刘卓婷, 王燕青, 曾又佳
中华肾脏病杂志, 2025, 41(
2
): 81-89. DOI:
10.3760/cma.j.cn441217-20240827-00831
图6
磷脂酶A2受体相关膜性肾病与铁死亡相关的交集基因LASSO和SVM?RFE分析以及交集基因获取
注:
A:SVM?RFE分析图;B:LASSO回归分析图(最优λ值为0.007 849 997);C:SVM?RFE分析与LASSO回归分析筛选特征基因的交集图;SVM?RFE:支持向量机递归特征消除;LASSO:最小绝对值选择与收缩算子
本文的其它图/表
表1
实时荧光定量引物序列
图1
PLA2R相关膜性肾病模型细胞铁死亡验证
注:
A:CCK?8法检测细胞增殖活性(
n
=6);B:人肾足细胞株AB 8/13在普通正置显微镜下的形态(×100);C:对照组和模型组Western印迹结果;D:PLA2R蛋白相对表达量(
n
=6);E:GPX4蛋白相对表达量(
n
=6);
a
P
<0.05,
b
P
<0.01;PLA2R:磷脂酶A2受体;GPX4:谷胱甘肽过氧化物酶4;β?actin:β?肌动蛋白;CCK?8:细胞活力检测试剂
图2
两组人肾足细胞株AB 8/13的形态(免疫荧光 ×200)
注:
F?actin:F?肌动蛋白;synaptopodin:突触足蛋白;DAPI:二脒基苯基吲哚
图3
健康对照组和磷脂酶A2受体相关膜性肾病(PMN)患者组差异基因筛选
注:
A:健康对照组和PMN患者组基因分析矫正、标准化处理后箱式图;B:主成分分析图;C:火山图;D:前20个差异表达基因热图;FC:差异倍数;GSM:基因表达数据库中的样本标识符(GEO Sample);
CCL3
:趋化因子配体3;
MAPRE3
:微管相关蛋白RP/EB家族成员3;
EGR2
:早期生长反应蛋白2;
FOSL1
:FOS样1;
MAFB
:MAF BZIP转录因子B;
SERPINE1
:丝氨酸蛋白酶抑制剂家族E成员1;
NR4A1
:核受体亚家族4组A成员1;
FOS
:FBJ骨肉瘤癌基因;
FOSB
:FosB原癌基因;
JUN
:Jun原癌基因;
B3GALT4
:β?1,3?半乳糖基转移酶4;
HTR2A
:5?羟色胺受体2A;
BMS1P5
:BMS1核糖体生物发生因子假基因5;
EID2
:EP300相互作用的分化抑制因子2;
RHBDD3
:含菱形结构域3;
GULP1
:含PTB结构域的吞噬作用适配器1;
EMID2
:含Emilin和多聚蛋白结构域2;
ELFN1
:含细胞外富亮氨酸重复序列和纤连蛋白Ⅲ型结构域1;
TRA1P2
:肿瘤排斥抗原1假基因2;
HLA
?
A29.1
:主要组织相容性复合体,I类,A29.1
图4
将差异表达基因与铁死亡相关基因取交集获取关键基因
图5
磷脂酶A2受体相关膜性肾病与铁死亡相关的交集基因的基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析
注:
A:GO功能富集分析图;B:KEGG功能富集分析图
图7
各组细胞中
ATF3
和
CCDC6
的mRNA表达(实时荧光定量PCR)
注:
ATF3
:激活转录因子3;
CCDC6
:卷曲螺旋结构域6;
a
P
<0.05,
b
P
<0.01
图8
各组细胞中ATF3、CCDC6蛋白的表达(Western印迹)
注:
A:模型组和对照组Western印迹结果;B:ATF3蛋白表达水平(
n
=6);C:CCDC6蛋白表达水平(
n
=6);CCDC6:卷曲螺旋结构域6;GAPDH:甘油醛?3?磷酸脱氢酶;ATF3:激活转录因子3;β?actin:β?肌动蛋白;
a
P
<0.05,
b
P
<0.01